Elegir el software correcto para tu clínica no es una decisión menor: afecta la agenda diaria, los cobros, el expediente clínico hasta toda la gestión de tu inventario.  AgendaPro y Kliniko resuelven problemas similares -gestión de citas, ventas, inventario- pero lo hacen desde filosofías distintas.
La diferencia más importante: AgendaPro es una plataforma multi-vertical con terminal de pago propia; Kliniko es un sistema clínico-administrativo 100% mexicano, especializado en clínicas de fisioterapia, estética y consultorios.

La respuesta breve: Si tu negocio necesita procesar pagos con tarjeta desde cero y opera en varias industrias (spa, belleza, salud), AgendaPro tiene ventaja por su TPV integrado. Si tu prioridad es la integración clínica profunda -expediente clínico conectado a la agenda y las ventas, facturación CFDI nativa y soporte local cercano-, Kliniko es la mejor opción para clínicas en México.

Resumen rápido: para quién es cada uno

 

AgendaPro es un software de agendamiento genérico diseñado para múltiples industrias: belleza, salud, bienestar. Cuenta con más de 20,000 negocios y 135,000 profesionales en Latinoamérica. AgendaPro ofrece más de 30 herramientas para gestión de negocios, incluyendo agenda online, marketing, cobros y reportes.
Su fortaleza diferencial: una terminal de pago propia integrada con el sistema. Sin embargo, AgendaPro no incluye funcionalidades de inteligencia artificial ni está diseñado para prescribir recetas electrónicas. AgendaPro carece de módulos específicos para clínicas y hospitales en sus planes básicos.

Kliniko es un sistema clínico y administrativo que centraliza operaciones de clínicas. Empresa 100% mexicana con soporte directo desde Puebla, está diseñado para clínicas de fisioterapia, clínicas estéticas, salones de belleza.
Kliniko ofrece agenda médica y expediente clínico conectados directamente al sistema de ventas. Kliniko destaca en la gestión de tratamientos y sesiones clínicas, y se enfoca más en la operación clínica diaria que en la captación de pacientes. Permite a los pacientes hacer reservas a través de un portal en línea y ofrece reportes en tiempo real. Precio desde $699 MXN + IVA/mes.

La decisión depende de si priorizas herramientas de pago integradas o especialización clínica profunda con soporte cercano.

Precio y planes: transparencia total

 

Aquí no hay letra chica. Estos son los costos reales publicados por cada plataforma:

Concepto

AgendaPro

Kliniko

Plan más básico

Individual: $299 MXN + IVA/mes (1 profesional)

Solo: $699 MXN + IVA/mes (1 usuario)

Plan intermedio

Básico: $550 MXN + IVA/mes

Starter: $999 MXN + IVA/mes (3 usuarios, 2 sucursales)

Plan avanzado

Premium: $1,500 MXN + IVA/mes

Pro: $2,199 MXN + IVA/mes (6 usuarios, 3 sucursales)

Plan empresarial

Pro: $4,500 MXN + IVA/mes

Enterprise: precio personalizado (ilimitado)

Expediente clínico avanzado

Desde plan Premium ($1,500 MXN)

Desde plan Starter ($999 MXN)

Inventario

Desde plan Premium

Desde plan Solo

Facturación CFDI

«Próximamente»

Incluida en todos los planes

Prueba gratuita

7 días

15 días gratis

AgendaPro tiene un precio de entrada más bajo ($299 MXN), pero ese plan solo incluye agenda, recordatorios automáticos, sitio web para citas y control de ingresos.
Para acceder a fichas clínicas personalizadas, consentimientos, inventario e informes avanzados, necesitas el plan Premium de $1,500 MXN.

Kliniko arranca más alto en precio ($699 MXN), pero ese plan Solo ya incluye agenda, sitio web para citas, ventas y cobros, facturación CFDI y soporte por WhatsApp. Kliniko ofrece prueba gratuita de 15 días para nuevos usuarios.

Costos extra a considerar: En Kliniko, los timbres CFDI cuestan $3.00 MXN + IVA cada uno, los mensajes de WhatsApp automáticos se compran por paquetes (ej. 500 mensajes por $249 MXN), y los usuarios adicionales van de $279 a $299 MXN/mes. En AgendaPro, la terminal de pago, paquetes de WhatsApp, módulos de API e integraciones avanzadas son costos adicionales al plan base.

Punto de venta y comisiones: la diferencia más importante

Si tu clínica cobra con tarjeta de crédito o débito en mostrador, este punto define la elección.

AgendaPro tiene terminal de pago propia (TPV). Se renta a $250 MXN + IVA/mes o se compra por $2,500 MXN + IVA. La comisión estándar para tarjetas nacionales Visa/MasterCard es de 2.29% + IVA. Si cumples requisitos de volumen, puedes acceder a tasas preferenciales: para doctores y dentistas, hasta 0.99% + IVA con ventas superiores a $300,000 MXN; para salones y spas, entre 1.39% y 1.99%. Además, permite meses sin intereses con bancos conveniados. 

Para pagos en línea, AgendaPro cobra 3.49% + IVA + $2 MXN por transacción con tarjetas nacionales no AMEX, y 5.19% + IVA + $2 MXN para AMEX e internacionales.

Kliniko no tiene TPV propia. Se integra con el método de pago que tu clínica ya use. Si ya tienes terminal bancaria, no hay problema: registras los cobros en el punto de venta para clínicas de Kliniko y listo. Pero si necesitas procesar pagos con tarjeta desde cero, tendrás que contratar una terminal de terceros por separado.

Ventaja: AgendaPro – La integración de TPV propia es una ventaja real e innegable si tu negocio no tiene terminal o quiere automatizar caja física, tener hardware propio ayuda con el cobro en sí, pero no garantiza que el proceso interno de caja sea confiable. Kliniko compensa con flexibilidad: puedes usar cualquier proveedor de pagos y no estás atado a comisiones específicas, asegurando un proceso mucho más robusto. 

Integración clínica y de inventario: dónde Kliniko domina

El problema real: muchas clínicas usan una herramienta para la agenda, otra para el expediente clínico electrónico, otra para facturación y otra más para inventario. Eso genera recaptura de datos, errores y tiempo perdido.

AgendaPro es, ante todo, un software de agendamiento general — la mayoría de sus usuarios son salones de belleza, barberías y centros de estética, no clínicas médicas. Por diseño, sus fichas clínicas son genéricas: no incluye codificación CIE-10 para diagnósticos, ni plantillas prediseñadas por especialidad médica. Para un negocio de belleza esto puede no importar; para una clínica que necesita documentación clínica real, es una limitación estructural, no un detalle menor.

Kliniko conecta la agenda online directamente al expediente clínico y al sistema de ventas. Kliniko es ideal para propietarios de clínicas ambulatorias y centros de fisioterapia. Kliniko gestiona la facturación electrónica y control de inventarios desde el mismo sistema. La facturación CFDI se integra en el sistema clínico, lo que permite evitar la recaptura de datos en plataformas externas. Kliniko es utilizado en clínicas que requieren una administración sencilla de citas y expedientes.

Casos concretos: Una clínica de fisioterapia necesita seguimiento de tratamientos, evolución del paciente, sesiones y documentos clínicos -Kliniko resuelve esto nativamente. Un centro de estética que maneja insumos, productos y consultas necesita inventario conectado al expediente -Kliniko lo incluye desde su plan Solo. Las reservas online ayudan a reducir no-shows en clínicas, y Kliniko permite reservas online desde todos sus planes.

Ventaja: Kliniko – La integración clínica profunda es su razón de ser. AgendaPro y Reservo ofrecen reservas online y recordatorios automáticos, pero la conexión nativa entre agenda, expediente y ventas es donde Kliniko marca la diferencia real.

Soporte y cercanía: ventaja geográfica de Kliniko

AgendaPro opera en varios países de Latinoamérica con un equipo regional. Ofrece onboarding guiado, recursos educativos y soporte multicanal. Es una plataforma madura con desarrollo continuo.

Kliniko es empresa 100% mexicana con soporte directo desde Puebla. Todos los planes incluyen capacitación en vivo, migración de datos y acceso a Kliniko Academy. El plan Pro ofrece soporte prioritario con tiempo de respuesta de aproximadamente 8 horas. La diferencia práctica: cuando necesitas resolver un problema con facturación CFDI, o procesos específicos del sector salud en México, un equipo local que conoce esas regulaciones responde más rápido. 

Ganador: Kliniko – El soporte local y la comprensión profunda de normativas mexicanas son ventajas tangibles. AgendaPro compensa con una base de conocimiento amplia y experiencia regional en múltiples países.

Checklist de decisión: elige tu herramienta ideal

Si marcas 3 o más, AgendaPro te conviene:

  • ☐ Necesitas terminal de pago (TPV) integrada con agenda, caja y reportes

  • ☐ Operas en varios países de Latinoamérica y necesitas una solución regional

  • ☐ Esperas alto volumen de pagos con tarjeta y buscas tasas preferenciales

  • ☐ Tu presupuesto supera $1,500 MXN/mes y necesitas funcionalidades premium desde el inicio

  • ☐ Marketing automatizado, campañas por correo electrónico y redes sociales son prioridad

Si marcas 3 o más, Kliniko te conviene:

  • ☐ Tu clínica está en México y necesitas facturación CFDI nativa

  • ☐ Priorizas expediente clínico avanzado conectado a la agenda y las ventas

  • ☐ Necesitas gestión de tratamientos, sesiones y seguimiento de paciente

  • ☐ Valoras soporte local, capacitación en vivo y flexibilidad en personalizaciones

  • ☐ Ya tienes terminal de pago o prefieres elegir tu propio proveedor

  • ☐ Tu especialidad es fisioterapia, estética, psicología o consultas médicas

Preguntas Frecuentes

¿Kliniko sirve para salones de belleza y barberías, o solo para clínicas médicas?

Sí. Aunque el expediente clínico es el corazón del sistema, Kliniko maneja agenda, comisiones, inventario y punto de venta igual de bien para salones de belleza y barberías — de hecho, la gestión de permisos por sucursal y el control real de caja (donde AgendaPro tiene las limitaciones que ya vimos) importan exactamente igual sin importar el giro de tu negocio.

¿Puedo migrar de AgendaPro a Kliniko o viceversa?

Sí. Ambos sistemas ofrecen migración de datos durante el onboarding. Kliniko incluye migración de datos en todos sus planes. La complejidad depende del volumen de información: clientes, historial de citas, expedientes digitalizados e inventario. Solicita un plan de migración detallado antes de contratar.

¿Cuál es mejor para clínicas de fisioterapia específicamente?

Kliniko. La fisioterapia requiere seguimiento de tratamientos, evolución por sesión, roles profesionales diferenciados y registros clínicos detallados. Kliniko está diseñado específicamente para este tipo de centros. AgendaPro ofrece fichas clínicas personalizadas desde el plan Premium ($1,500 MXN/mes), pero su enfoque es más generalista. Aquí puedes ver los 5 problemas comunes en la gestión de clínicas de fisioterapia que un sistema especializado resuelve.

¿Cuál tiene mejor integración con CFDI y normativas mexicanas?

Kliniko. La facturación CFDI está integrada nativamente en todos sus planes, con timbres a $3.00 MXN + IVA cada uno. Un sistema clínico integra facturación CFDI dentro de la plataforma, eliminando la recaptura de datos. 

Conclusión: toma la decisión correcta para tu clínica

Esta comparativa AgendaPro vs Kliniko se reduce a una elección clara:

  • Elige AgendaPro si tu negocio es multi-vertical (spa, belleza, bienestar), necesitas terminal de pago integrada desde cero, operas en varios países y priorizas herramientas de marketing y cobros automatizados.

  • Elige Kliniko si tu clínica está en México, necesitas expediente clínico conectado a la agenda y las ventas, facturación CFDI nativa, gestión de tratamientos y un equipo de soporte que entienda tus procesos clínicos y normativas locales.

La mejor herramienta no es la más popular ni la más barata: es la que resuelve tu problema específico. Si priorizas la operación clínica diaria sobre la captación masiva, Kliniko fue diseñado exactamente para eso.

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